По данным муниципальной программы «Комфортный город», экологическая ситуация в Калининграде характеризуется как напряжённая. Основные загрязнители: автотранспорт, теплоэнергетика, промышленность и бытовые отходы.
Несмотря на то, что за 13 лет в Калининграде закрыли и переоборудовали под газовое использование 81 котельную, экологических проблем в городе хватает.
Тревогу вызывают загрязнения рек и незаконные сбросы в море.
В прошлом году зарегистрировано 102 случая загрязнения малых рек и озёр. Калининградская область стала второй в России по этому показателю. Чаще всего водные объекты загрязняли ионами марганца и легкоокисляемыми органическими веществами.
Ранее море на пляже в Пионерском окрасилось в мутно-серый цвет из-за того, что со стройплощадки газораспределительной станции в Светлогорске сбросили в реку известь.

Сброс неучтенных канализационных стоков обнаружили в Балтийском море, из-за чего в прибрежной зоне была мутная вода и шла пена из труб.

Сбросы неочищенных сточных вод обнаружили и в Гурьевске. Вода в реке Гурьевка стала мутной и грязной, жители сообщали, что погибло много рыбы, и жаловались на вонь. По их словам, жить в городе стало невозможно, многие пытаются продать свои таунхаусы, но покупателей пока не находится.